細胞治療是指利用某些具有特定功能的細胞的特性，採用生物工程方法獲取和/或通過體外擴增、特殊培養等處理後，使這些細胞具有增強免疫、殺死病原體和腫瘤細胞、促進組織器官再生和機體康復等治療功效，從而達到治療疾病的目的。細胞治療大致可分 為三領域:

現時細胞治療已成為研究的熱點，不管是對T細胞進行生物工程、乾細胞對於特定疾病的治療、觀察免疫細胞和腫瘤細胞的相互作用、開發抗癌疫苗等，都是細胞治療研究的重要課題。

再生醫療: 主要使用自體或異體存在於各組織的 乾細胞，進行組織或器官的修復，例如把眼球乾細 胞抽出，於體外增殖，再打回眼球，以修復眼角膜， 或是把心肌乾細胞打入心臟，欲治療心肌梗塞等等，對醫藥或醫材無法取代的病狀的確有幫助。但是再生醫療開發至今十多年，全球至今只有個位數產品被核准上市，其他尚在臨床實驗階段。一般而言，存在於自身組織的自體乾細胞為數不多，如何找到並鑒定是一大的挑戰。與自體細胞相比，相對容易取得且乾細胞數量豐富的臍帶血或羊水乾細胞因此受到重視，然而這類異體乾細胞的實際功能、安全性、施打劑量、施打頻率等變數均攸關到最終的療效驗證，故相對於一般新藥開發，乾細胞臨床實驗複雜度來的更高。

癌症免疫治療: 細胞是體內最強且帶有記憶的殺癌特攻隊，以基因灌能 T 細胞的 Car T 技術則加強對腫瘤的辨識，並加入其他免疫激活因子，而比原始T細胞更強大。Car-T 在復髮型及難治型的血液腫上，達到 60 至 80% 的高療效，相當驚人，但在固體癌則尚有挑戰，包括未找到特異性極高的腫瘤抗原、細胞不易在固體腫瘤的酸性低氧環境存活等問題待克服，可能還要 5 至 10 年的研發時間，才能看到績。其他未基改的原始免疫細胞治療，即本次台灣細胞特管法開放的部份，則為輔助治療角色，須與傳統癌症治療搭配。

基因治療: 基因治療乃遺傳病患的希望，將改良過的基因導入乾細胞或體細胞，再打入病患體內，期待由根源治療遺傳缺失疾病，全球至少有 4000- 7000 種遺傳性疾病，近幾年基因治療療效佳，成為美國募資最高的細胞治療領域。